Miura Naoto, seorang siswa dropout yang jenius.

 
Dia tinggal di dunia yang telah dieksploitasi secara berlebihan. Bahkan seluruh permukaan dunia telah menjadi mesin.

 
Suatu hari, sebuah kotak berisi perempuan otomata menabrak rumahnya.

 
Hal tersebut merupakan pertanda kejadian yang akan mengguncang dunia sekaligus memberi kesempatan pada Naoto untuk menjadi seorang pahlawan.